Stanice přečerpávání odpadních vod nefunguje dobře, pokud je čerpadlo zvoleno pouze podle velikosti výstupu nebo výkonu motoru. První čísla ke kontrole jsou průtok, výška zdvihu, délka potrubí a počet kolen. Dlouhé trubky a mnoho ohybů zvyšují ztrátu hlavy, takže skutečná pracovní hlava je často vyšší než jednoduchá vertikální výška. Důležitý je také stav vody. Pokud kapalina nese papír, měkké pevné látky nebo drobný písek, čerpadlo potřebuje dostatečný průchozí prostor a vhodný typ oběžného kola.
Pro každodenní provoz je třeba zvážit také uspořádání stanice. Systém vodicích lišt může usnadnit zvedání a kontrolu. Nastavení provozního a záložního čerpadla je běžné, když se stanice nemůže na dlouhou dobu zastavit. Před instalací je třeba zkontrolovat délku kabelu, nastavení ovládací skříně a polohu spínače hladiny. Tyto malé detaily pomáhají čerpadlu startovat a zastavovat při správné hladině vody a zkracují zbytečnou dobu chodu.